如何判斷一個芯片結果的好壞?
發布日期:2020-03-04
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從圖象來看，主要看有無劃痕，有無圖象缺失，圖象是否清晰，背景是否過高, .點是否規則，大小是否均-，有無融點，拖尾等現象，圖象均一-性如何，是否存在邊緣不清晰，陽性及陰性內參的情況等。
從數據來看: (1) 檢出率是否異常: (2)重復性如何(相關系數); (3)變異系數(CV值): (4)與qPCR趨勢的吻合程度: (5)技術重復中差異基因的重復程度等。
補充:有無劃痕或有無圖像缺失，各個生產廠商有不同的界定。因為和所有的工業產品一樣，芯片在制造的過程中不可避免會產生瑕疵。為了避免對雜交后數據的影響，數據的芯片在設計的時候已經考忠到了數據冗余量，小而積的數
據點喪失不會對芯片數據造成影響，如: Affymetrix 芯片能耐受的瑕疵區域而積是不超過芯片面積的2.5%。
據點喪失不會對芯片數據造成影響，如: Affymetrix 芯片能耐受的瑕疵區域而積是不超過芯片面積的2.5%。
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